Intussen had hoofdingenieur Kurt Prüfer zijn intrede gemaakt in het bedrijf. Vanaf 1941 zal het Department D IV voor "Gespecializeerde Oven Constructie" onder het management van Kurt Prüfer een beruchte reputatie opbouwen als de belangrijkste leverancier van crematoria en ovens aan de concentratie- en vernietigingskampen van de SS.

Kurt Prüfer werd geboren op 21 april 1891 en was de zoon van de ingenieur Hermann Prüfer. Na de lagere school, werkte hij een tijd in de bouw als leerjongen metselaar tot hij opnieuw zes semesters school volgde in Erfurt als bouwkundig ingenieur. Wanneer hij twintig werd kon hij op 15 juni 1911 aan de slag bij J. A. Topf & Sons waar hij een jaar als 'Bauleiter' werkte tot hij werd opgeroepen voor militaire dienst.

In de Eerste Wereldoorlog vocht hij onder het Erfurt 71ste Infanterie Regiment aan het Westelijke front. Na de oorlog keerde hij, in de rang van reserve-sergeant en dat zonder een schrammetje te hebben opgelopen, terug naar Erfurt. Hij vervolmaakte zijn studies en kon op 1 april 1920 weer aan de slag bij Topf & Zonen. In 1925 was hij opgeklommen tot ingenieur en kreeg een commissie van 1% op de totale omzet van het bedrijf toegekend. Vanaf 1928, kwam hij aan het hoofd te staan van de "Krematoriuimbau" [crematorium constructie] afdeling en zal een cruciale rol spelen in het bewerkstelligen van het bedrijf Topf & Sons als marktleider in dit bepaalde onderdeel.

Tijdens de economische crisis van de beginjaren dertig, kon hij zijn ontslag enkel afwenden door een aanzienlijke vermindering van zijn loon te accepteren. Zelfs nadat Prüfer in 1935 werd aangesteld als hoofdingenieur, bleef zijn macht binnen het bedrijf eerder beperkt. Niet gemachtigd om ook maar gelijk welk dokument te ondertekenen bleef hij aldus afhankelijk van zijn superieuren voor wat de verkoopscijfers van zijn ontworpen ovens betrof.

In april 1933 was Prüfer lid geworden van de NSDAP, de partij van Adolf Hitler, net zoals ook de gebroeders Topf dat voordien deden. Op 2 december werd Prüfer gepromoveerd tot hoofdingenieur van het bedrijf. Vanaf het ogenblik dat de SS in 1939 crematoria begon te bouwen in de concentratiekampen greep Prüfer de kans aan om zowel zijn reputatie als zijn inkomen te verbeteren.

Door zijn partijkaart van de NSDAP kreeg hij goede relaties met de Duitse Wehrmacht (het leger) en de SS, begon het bedrijf wapens te produceren voor de herbewapening. Tegen het einde van 1940 had Topf & en Zonen legerorders uitgevoerd voor een waarde van 342.328 Rijksmark. Tijdens de Tweede Wereldoorlog zal Topf & Zonen verder wapens blijven produceren zoals speciale granaten alsmede onderdelen voor de Heinkel 111, de standaard bommenwerper van de Duitse luchtmacht.